1. 按照定位***別分類。可以分為學生***、實驗***、研究***生物顯微鏡。
2. 按照目鏡的個數分類。可以分為單目型、雙目型、三目型生物顯微鏡。
按照目鏡個數分類3. 按目鏡和移動臺的相對位置分類。可以分為正置生物顯微鏡和倒置生物顯微鏡。正置(常規)生物顯微鏡的物鏡在移動臺的上方，倒置生物顯微鏡的物鏡在移動臺的下方。
按照目鏡和移動臺相對位置分類4. 按成像原理分類。可以分為光學生物顯微鏡和電子生物顯微鏡。
光學顯微鏡主要由目鏡、物鏡、載物臺和反光鏡(集光鏡)組成。目鏡和物鏡都是凸透鏡，焦距不同。物鏡的凸透鏡焦距小于目鏡的凸透鏡的焦距。物鏡相當于投影儀的鏡頭，物體通過物鏡成倒立、放大的實像。目鏡相當于普通的放大鏡，該實像又通過目鏡成正立、放大的虛像。經顯微鏡到人眼的物體都成倒立放大的虛像。
顯微鏡的成像原理電子顯微鏡是根據電子光學原理，用電子束和電子透鏡代替光束和光學透鏡，使物質的細微結構在非常高的放大倍數下成像。由于電子束的波長遠遠小于可見光的波長，所以即使電子束的錐角僅為光學顯微鏡的1%，電子顯微鏡的分辨本領仍遠遠優于光學顯微鏡。光學顯微鏡的放大倍率約為2000倍，而現代電子顯微鏡放大倍率已經超過了300萬倍
[1] 。
電子顯微鏡生物顯微鏡的基本結構
生物纖維鏡的結構1. 鏡座。位于顯微鏡底部，用于支持全鏡。
2. 鏡臂。位于鏡筒后面，通常為弓形，用于支持鏡筒和搬移顯微鏡時握持部位。
3. 鏡筒。位于顯微鏡上方，上接目鏡，下接物鏡轉換器。
4. 物鏡轉換器。位于鏡筒下方的轉盤，通常有3~4個圓孔，可裝配不同放大率的物鏡，可使每個物鏡通過鏡筒與目鏡構成***個放大系統。
5. 移動臺。又名載物臺、工作臺或鏡臺，用于放置標本。移動臺上有兩個金屬壓片夾叫標本夾，用于固定玻片標本。有的載物臺上裝有推片器用來移動標本，有的載物臺本身可以移動。
6. 調焦裝置。為了得到清晰的圖像，必須調節物鏡與標本之間的距離，使物鏡的焦點對準標本，這***操作叫調焦。調焦通過粗準焦旋鈕和細準焦旋鈕來實現。
7. 物鏡。安裝在鏡筒下端的物鏡轉換器下方，因為它靠近被視物體，故又稱接物鏡。物鏡是決定顯微鏡性能如分辨力的*重要的構件。物鏡的作用是將標本次放大成倒像。***臺顯微鏡備有數個物鏡，每個物鏡由數片不同球面半徑的透鏡組成。物鏡下端的透鏡口徑越小，鏡筒越長，其放大倍數越高；否則反之。物鏡有低倍物鏡和高倍物鏡，其放大倍數***般刻在物鏡的鏡筒上，例如4×、8×、10×、……、100×，分別表示4倍、8倍、10倍……、100倍。其中40-65倍叫高倍物鏡，90或100倍的稱為油浸物鏡。
8. 目鏡。安裝在鏡筒上端，因為它靠近觀察者的眼睛，又稱接目鏡。目鏡的作用是將由物鏡放大的實像進***步放大成***個起立的虛像，其作用相當于***個放大鏡。但它并不增加顯微鏡的分辨力。目鏡的視野內有***條黑線，叫做“指針”，可以指示所觀察的部位。根據需要，目鏡內也可安裝測微尺，用以測量所觀察物體的大小。***般顯微鏡備有幾個放大倍數不同的目鏡，其放大倍數刻在目鏡邊框上，如5×、10×、15×等（顯微鏡的總放大倍數=物鏡放大倍數×目鏡放大倍數）。
9. 聚光鏡。安裝在移動臺下方支架上，主要由聚光鏡和孔徑光闌組成。聚光鏡作用是會聚集光鏡的光線，增加標本的照明。孔徑光闌又稱光圈用來調節光線的強弱。在孔徑光闌下面，通常還有***個圓形的濾光片架，可根據鏡檢需要放置濾光片。
10. 光源。通常安裝在顯微鏡的鏡座內提供光源。
生物顯微鏡的使用方法
1. 取用和放置。從鏡箱中取出顯微鏡時，必須***手握持鏡臂，***手托住鏡座，保持鏡身直立，切不可用***只手傾斜提攜，防止摔落目鏡。要輕取輕放，放時使鏡臂朝向自己，距桌子邊沿5-10厘米處。要求桌子平衡，桌面清潔，避免直射陽光。
2. 開啟光源。打開電源開關。
3. 放置玻片標本。將待鏡檢的玻片標本放置在移動臺上，使其中材料正對聚光鏡中央。然后用彈簧壓片夾在玻片的兩端，防止玻片標本移動。再通過調節玻片移動器或調節移動臺，將材料移至正對聚光鏡中央的位置。
4. 低倍物鏡觀察。用顯微鏡觀察標本時，應先用低倍物鏡找到物像。因為低倍物鏡觀察范圍大，容易找到物像并定位到需作精細觀察的部位。方法為：
1) 轉動粗準焦旋鈕，用眼從側面觀望，使鏡筒下降，直到低倍物鏡距標本0.5厘米左右。
2) 從目鏡中觀察，用手慢慢轉動粗準焦旋鈕，使鏡筒漸漸上升，直到視野內的物像清晰為止。此后改用細準焦旋鈕，稍加調節焦距，使物像*清晰。
3) 微調移動臺或玻片移動器，找到欲觀察的部分。要注意通常顯微鏡視野中的物像為倒像，移動玻片時應向相反方向移動。
5. 高倍倍觀察。在低倍觀察基礎上，若想增加放大倍數，可進行高倍觀察。方法為：
1) 將欲觀察的部分，移至低倍鏡視野正中央，物像要清晰。
2) 旋轉物鏡轉換器，使高倍物鏡移到正確的位置上，隨后稍微調節細準焦旋鈕，即可使物像清晰。
3) 微調移動臺或玻片移動器，定位欲仔細觀察的部位。
注意：使用高倍物鏡時，由于物鏡與標本之間距離很近，因此不能動粗準焦旋鈕，只能用細準焦旋鈕。
6. 換片。觀察完畢，如需換用另***玻片標片時，將物鏡轉回低倍，取出玻片，再換新片，稍加調焦，即可觀察。不允許在高倍物鏡下換片，以防損壞鏡頭。
顯微鏡使用注意事項
1. 顯微鏡是精密
儀器，使用時必須按照操作規程，做到細心和耐心，切勿操之過急、動作過猛，以防操作失誤而損壞構件
[2] 。
2. 不要用手觸摸光學玻璃部分，同時防止劇烈碰撞而損壞構件。
3. 觀察時***定要加蓋玻片，不能讓玻片上的水流到移動臺上，更不能讓酸、堿及其他化學藥品接觸顯微鏡，不能讓顯微鏡在陽光下曝曬。
4. 使用細準焦旋鈕時，如遇到不能繼續向同***方向轉動而到達極限時，不能蠻擰，應向相反方向退轉，并轉動粗準焦旋鈕，然后再用細準焦旋鈕進行細調。
5. 目鏡或物鏡如有不潔時，要用專門的鏡紙作直線方向揩拭，切勿用手指或手帕及棉布涂擦。目鏡或物鏡如沾有油污，可先用專門的鏡紙沾少許二甲苯，再用干凈擦鏡紙揩拭***遍。
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